Javier Bracho estudió en la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). Obtuvo su doctorado en el Instituto Tecnológico de Massachusetts y a partir de entonces es profesor de la Facultad de Ciencias e investigador del Instituto de Matemáticas de la UNAM del cual fue director.
Su trabajo de investigación se ha desarrollado en las áreas de geometría algebraica, topología algebraica, combinatoria y geometría discreta. Su interés en la divulgación y la enseñanza de las matemáticas lo llevó a participar en el diseño de la sala de matemáticas del museo Universum, proyecto que derivó en colaboraciones y obra con artistas plásticos.
